玉溪農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院的前身是國家級重點中專玉溪農(nóng)業(yè)學(xué)校，學(xué)校成立于1956年，1991年經(jīng)省教委評估認(rèn)定為“合格中專學(xué)校”;1993年被省政府認(rèn)定為“省部級重點中專學(xué)?！?，同年省政府批準(zhǔn)建立“云南省玉溪煙草栽培學(xué)校”;1996年被省科委、團(tuán)省委定為“云南省青年星火技術(shù)培訓(xùn)示范基地”，并獲云南省農(nóng)業(yè)中專教學(xué)規(guī)范化管理一等獎;1997年省教委命名為“省級文明學(xué)?！?1998年被省委、省政府命名為“省級文明單位”;1999年被省委、省政府命名為“文明單位工作先進(jìn)單位”;2000年首批步入國家級重點中專行列。于2002年3月22日經(jīng)省政府批準(zhǔn)，國家教育部備案，成立以舉辦高等職業(yè)技術(shù)教育為主、面向全國招生的普通全日制公辦高等職業(yè)學(xué)校（即玉溪農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院）。

學(xué)院已基本形成了以?？茷橹黧w、中專、本科多層次學(xué)歷教育和各類短期培訓(xùn)并存的辦學(xué)格局，現(xiàn)有全日制在校生3000多人。學(xué)院設(shè)有煙草栽培技術(shù)、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)、生物資源開發(fā)與利用、觀賞園藝、園林設(shè)計、計算機(jī)應(yīng)用技術(shù)、計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、廣告藝術(shù)設(shè)計、計算機(jī)多媒體技術(shù)、室內(nèi)設(shè)計、財會會計、金融保險、社區(qū)管理與服務(wù)、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)管理、市場營銷、電子商務(wù)、畜牧獸醫(yī)、動物醫(yī)學(xué)等18個專業(yè)。學(xué)院是第110個國家職業(yè)技能鑒定所，面向?qū)W生和社會開展農(nóng)林牧、園藝、會計、計算機(jī)等行業(yè)的相關(guān)等級培訓(xùn)和鑒定，頒發(fā)全國統(tǒng)一的職業(yè)資格證書。